ssgep-single-sample-expression单样本无重复表达谱技能（SSGEP — Single Sample Gene Expression Profile）。植物/梨属等转录组表达谱分析全流程：原始数据获取→质控定量→差异与GO/KEGG富集→WGCNA共表达→SNP遗传分化→600DPI出图→论文三格式(HTML/DOCX/PPTX)+Shiny交互。**明确支持两种模式**：模式A 单样本无生物学重复（每个条件仅1样本，用固定离散度0.1+折叠变化法）；模式B 有生物学重复（标准DESeq2/edgeR离散度估计+设计公式）。当用户要做RNA-seq表达谱、差异基因(DEG)、WGCNA、功能基因挖掘，或要求"出论文三格式/做表
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Generated Sep 8, 2026
针对梨属5品种×7发育阶段的单样本表达谱，本技能能够执行全流程分析，包括数据质控、差异表达、WGCNA共表达网络构建、SNP遗传分化分析，并挖掘褪黑素通路相关功能基因，帮助研究人员识别关键调控因子。
许多植物研究受限于样本数量，每个处理组仅有一个生物学重复。本技能的模式A通过固定离散度和折叠变化法对这些数据进行分析，确保即使无重复也能得到可靠的差异表达基因，并支持后续富集分析和网络构建。
研究人员可以直接从fastq数据出发，在分析完成后自动生成符合期刊要求的高清图片（600DPI）和论文三种格式（HTML/DOCX/PPTX），并附带Shiny交互应用，用于数据探索和结果展示，大幅提升工作效率。
针对不同品种或种质资源，技能能够识别SNP位点并评估遗传分化参数（如pN/pS），帮助育种家理解品种间的遗传差异，并关联到性状相关基因，为分子标记辅助育种提供依据。
为高校、科研院所提供定制化转录组分析服务，从数据上传到最终报告交付，收取固定的项目费用。服务内容涵盖全流程分析或独立模块（如差异表达、WGCNA）。
为生物信息初学者或研究团队提供技能培训，包括环境搭建、流程操作和结果解读，并提供实时咨询。可通过线上课程、工作坊或一对一方式进行。
将技能封装为标准化工具或插件，向企业或研究机构销售使用许可，同时提供API接口和定制开发服务，以满足特定物种或分析需求。
💬 Integration Tip
确保分析脚本和依赖环境（R/Python）已正确配置，并预先整理好数据格式以满足输入要求。
Scored Sep 8, 2026
Perform advanced filesystem tasks including listing, recursive searching by name or content, batch copying/moving/deleting files, and analyzing directory siz...
Safely organize, deduplicate, and analyze files with intelligent bulk operations and full undo support.
A product deletion skill based on the "Bee Website Builder" Open API. It is used to delete one or more products under a specified site language and supports...
Find and remove duplicate files intelligently. Save storage space, keep your system clean. Perfect for digital hoarders and document management.
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